Cuando se elimina un producto, se mantiene en la base de datos de productos como productos eliminados. Por lo tanto si no los quieres más en la base de datos, debería hacer lo siguiente en la versión web. Es decir
Base de datos > Productos > Ver / Editar > Configuración
Seleccione Productos eliminados > Guardar
En la pantalla verá los productos que se han eliminado. Podra seleccionar uno por uno o seleccionar todo para borrarlos
Uno por uno > Click en icono > Cesta
Todos los items > icono > Cesta
Una vez se han eliminado los items, debe hacer clic en la configuración para desactivar la opción Productos Eliminados > Guardar